2199 год. Инопланетная раса гамилусиан, чья военная мощь в разы превышает силы человеческой цивилизации, нападает на Землю. После обстрела поверхность планеты становится непригодной для жизни, люди уходят под землю, но рано или поздно радиация доберется и туда. Последней надеждой на спасение становится космический линкор Ямато, отправившийся к дружественной землянам расе за технологией Космореверса, которая поможет вернуть голубой планете прежний облик. И вот мир заключен, союзники найдены, Космореверс на борту линкора — казалось, ничто не предвещает беды. Но на краю Большого Магелланова Облака на судно нападает таинственная группа инопланетян, сражение с которыми привело «Ямато» и его экипаж к непредсказуемым последствиям.